— Rational design of CRISPR/Cas target.
2025-06-22 03:41:41, GGGenome : Mouse genome, GRCm39/mm39 (Jun, 2020)
Summary:
Results:
Matches are highlighted with blue background.
Mismatches and in dels are marked in red.
GCAGTCTTCCTTAGATTTCCAAAAGAGTCC7361244 TTCAGGTGGTGCTGT
TATGTATGTATGTATGTATTTATTTATTTA9980533 TTT AGGTGGTGCTGG
GGTCTGCACAGACTCCTGCTTTGGGTGGCT11239642 TTCT GGTGGTGCTGG
GGTCTCTGAAGCATCTTTAAGATGGAAAAC15710235 TTCAGGTGGTGG TGG
GAGATATGATTTTAAATCCGAATCTTGCTT16394832 TTCAGGT-GTGCTGG
ACTTTCTAAAGTCAGGTCTTTCCTTCTACT20926917 TTCAGGTG GGTGCTGG
GCTACAGGTCCCTGCTGTCCCTGGGCCTGT20965679 TTCAT GTGGTGCTGG
TAGTAGGGTGACTGCCAAAAACGACAAAGT21214347 TTCAGG-GGTGCAGG
TTGGGTTTTAATAATACCAAAAGCAATGTT23083925 TTCA-GTGGTGCTGG
TCATGCATCTGGATATACACACACTTGGAG23193162 TTCAGGTGGT-CAGG
AGGGAGAGCTTTCTTATGCCCCTGTTTCTT24388849 TTCAGGA TGGTGCAGG
AGGGACTGAAGTTACAAATGGTGGTAACTT25739760 TTCAT GTGGTGCTGG
GAGTATGGCTGAATATGTGCACCATTGTAG29096510 TTCAGGTA GTGCAGG
TAGATAAAGTTGTAGCAGGTTGGAGAGGAT29418206 TTCAGG-GGTGCAGG
CCGACTTCCTACTAATGCCTCAAATGAGTA29696171 TTCAGC TGGTGCTGG
CCTGATCATTGGCTCCTCAGTCAGTCAGAA35272549 A TCAGGTGGTGCTGG
GTCAGTTGGCATATTGACATCACTACTACT37491813 TTCAGGT-GTGCTGG
ACTTATTAGTGTCACACAAAATCTTGGGGC42484063 TTCAGGTGC TGCGGG
AAAACAAACAGCTTCCGATGAGAAGGATCA43249697 TTCAGGTGGTGCCA G
GCAACACTGAGATGGCTGTTGATCTGATCA43688931 TTCAGGTGGTGG TGG
GTGTGGCTGTGAAGACCGACAAAGGCTCTC47006542 TTCAC GTGGTGCTGG
GAGATAGGATTTTAGATAAGCTTCTTGATT49224548 TTCAGGT-GTGCTGG
TCCTGGGTTTCCCTTGAGCATCCAGATGTT57280988 TTCAGGTGGTC CTGG
GGATAACTTTCATGGGTTCCAGAGATGAAA62864654 TTCAGGTGGT-CAGG
GCTACACCACAGATGTCCGTCTTGCCGCCC71681196 TTC-GGTGGTGCAGG
TAGACCTTGGAGTGAAAGTATCATCTCTAG72388163 G TCAGGTGGTGCAGG
GGATTACAGGCAAGTGCTGCCATGTCTGGT72976674 TTCAT GTGGTGCTGG
TCATAGCCATCTACAGGGAGAAGTGGAGAG75293468 TTCAGGTGGC TGCCGG
GGACCTAACAGACTGTGCCACCATGCCTGG75341447 TTCAT GTGGTGCTGG
GAGTCACAGTCATATGTCATCATTACTGGT77627326 TTCAT GTGGTGCTGG
GTGTAATTATGAATGGTATAAAAGATGCTT80871645 TTCAG GGTGGTGCAGG
GAGATAGGCTTTTAGATCAGCATCCTGGTT81238480 TTCAGGT-GTGCTGG
ATCTAAGGATGGGTCTTCAAAGGTGATATT84719998 TTCAGGTGGTGT GGG
GATAATTTGTGTTTAGTGAAACTGCAGGCC87013401 TTCAGGTGG-GCAGG
CTCTGAGGGTTGGAAGCCTGGCTTGCTCGT91463023 TTCAGGT-GTGCAGG
GAGATATAATTTTAAATAGAAATCTTGCTT98367912 TTCAGGT-GTGCTGG
GCTGCAGCTGGACTTGGTAATGTGTAAAGG100064651 G TCAGGTGGTGCTGG
GTACAGGTGTCCACCAGCATGGTTGTTTCT102377577 TTCA-GTGGTGCTGG
CCTTTGCAGCAGATGAGTGTCTATGGGGGA105786415 TTCAGGTGGTGG GGG
AATCACACATGAGGCTCACGTATTCTTTTG106456932 TTC-GGTGGTGCTGG
GGACAGGTCTTTGGAGTTTTCTTTCTAACC118871151 TTCAGGTGGTT CTGG
GCTGCTCATGTCACTGGCACTTTATAAAGA119015554 TTCAGGT-GTGCAGG
ACTACGTGTCCCAGTAAAGCAAAGGTTGAT119288763 TTCA-GTGGTGCTGG
TTCTTGCTCCATATGTGTCCTGGGAACAAA128208613 TTCAGGTGGT-CAGG
ACATAGCCCAGGCTGGCCTTGAATTCTGGG128288062 TTCAC GTGGTGCTGG
GGATTATAGGCCTGCACCAACCACACCCAA128798934 TTCAT GTGGTGCTGG
TCTGAGAGTGAACAGGCTGGCTTGGCTAAG131120897 TA CAGGTGGTGCTGG
CCGCTTGGTCCAGTTTGTAAAAGACAGAAT131578494 TTC-GGTGGTGCAGG
GATGACATGCCCAGGGGCTGCCAGTTTCTC133133240 TT-AGGTGGTGCTGG
GTCTGGAACCTTACCTGGGGAAGGGCGGAG134260044 TTCAGGTGGC GCTGG
GTGCGTGAGCAGCCCCCACTCCCAACCCCT134632882 TTCAGGTGG-GCAGG
GAACCCTGCTGGACGAGTGGCTTAGGTTCC139697645 TTCAGGTT GTGCTGG
GGAACCCTGCTGGACCAGTGGCTTAGGTCC139746409 TTCAGGTT GTGCTGG
CCTGAGGTAAAGGAGTTGTATTGTCCATAT142986436 TTCAGT TGGTGCTGG
TGGGTGCTCACGAAGGTCAGAGGTATCAGA150538639 TTCAGC TGGTGCTGG
TAGCTGCTTGTGTGGGTCCTAGGCAGCAAG156385076 TTCAGGTGGT-CAGG
TGGGCCAGAGAACTTCCTCAGGTATCGTTC157624685 TTCAGGTGGTGCTGA
ATCTCTGGTATTCAATAAAGTACCCAGTTG162367064 TT-AGGTGGTGCAGG
CCGCTTGGTCCAGTTTGTAAAAGACAGAAT164056305 TTC-GGTGGTGCAGG
CCGCTTGGTCCAGTTTGTAAAAGACAGAAT170777103 TTC-GGTGGTGCAGG
CCGCTTGGTCCAGTTTGTAAAAGACAGAAT171316734 TTC-GGTGGTGCAGG
AAATAACCTGTAAAGTTTAGAAAGGATATC172138489 TTCAGGTGGTGG CGG
CAGCGAGGAGGTTCACACTCATGCTACCCT178981790 C TCAGGTGGTGCAGG
GGCAAGGATGCTGCTGTCTCCTGGTGCCCC182274051 TTCAGGTGGT-CAGG
CAGGTGGGAGCCTCCCACACATGATTATTT183702679 TTA AGGTGGTGCTGG
GGTGTGCTTCCGGGGCATTGTAGCCGTATC187348586 TTCA-GTGGTGCAGG
TCACTCAGTCGGATGGGCAGTTCTGCTGGC189319590 TTCAGGT-GTGCGGG
GCTTCCTCTGGACAGAGCTGCTGCCACTGA189371028 TTCAGGTGGTG-TGG
GGAAAACAGCATGGATAAACAGCAAAGGGG189925619 TTCAGGTGC TGCTGG
TTCTCCAATGCATAGGAACATGTTTGGAAG191640219 TTCAGGTGGTGCGT G
GTGTGTGCTGTCCCTTACCTCAGCAGCAGC192170473 TTCAGGTGGG GCGGG
TTTCTCAGGCTGCCGGGAAGATGGCGGCTA192570889 TTCAGGTGGTGCAT G
ATCTACAAATTATCCTTTGTGACATTTTCT192973416 TTCAGGTGGTC CTGG
AAAGATGTTGTGGCTGTGAAAATGGGGGCT4392629 TTCAGGTGGTGCTGA
CTTTAGGTTGAAAACACTCTGGGGATTGCC10152343 TTCAGGTGC TGCTGG
ACAAGATCATCCTGCCTTAGGCTTCCTGAT12324902 TTCAGGT-GTGCCGG
AGATCCCCTGGAGCATTGCAGTTGTGAGCC19548959 TTCAT GTGGTGCTGG
CTTCTGACTTGCCCTTACCCAAGCTCTGCA19971802 TTCAGGTGGTGG TGG
GGGTTCAGGAGATGCAGTAGTCAGAGAGCA20873020 G TCAGGTGGTGCTGG
TGGGAATGCCTCATTTGCATAAGGAGGAAT22618886 TTCAGGTGC TGCAGG
GTAACAAAGTCAAGGTCTGGTTCAGTGAGC23854114 TTCAGGTGGTGG TGG
GCAGTTGTGGGTGGAAGAGCTGAGATTCCA25600780 TTCAGGT-GTGCTGG
CAAAACCAGCCAGTACAATGTCCTAAAATT29104682 TTCAGGT-GTGCTGG
GCACTTCCAGGACACTGAGAGGAATACATG29263279 TTCAGG-GGTGCTGG
AAGAATCGTTCTGCAGATCACGGAGCAGTG29427786 TTCAGGTGGG GCAGG
GTTCTCAGCCTGTAGGTTCTAAGGATAGAA30473429 TTCAGGTGGT-CAGG
CGGTCCGCCTCTGGGTCTGCGCTCTCGGCG30691181 C TCAGGTGGTGCAGG
TACAGCTAGCTCAGTTCTCCGCGCTTGAGT31010156 TTCAT GGTGGTGCGGG
CTCCTTTTCTGACTGCTGACAGACCTAGGC31075776 TTCAGGTGT GTGCTGG
AGTTGGGCCTGGAGCCCAGCGAGGAGGTGG32651649 TTCAGGC GGTGCTGG
AGGATCTCTCACTGAGCCAGAAGCTGCAAT34669905 TTCAGGTGG-GCTGG
TAGGAGCACATAGAATGCCAGCTAACCATG34928652 TTCAGGTGGT-CAGG
CACACCAGTCAGAATGGCTAGGATCAAAAA38061756 TTCAGGT-GTGCTGG
GACTCACCACTGTGAATTCTCAGGTGTTCT44888919 TTCAGGTGGTGCTT G
CTGGGCTGCAGGTGTTGAGTTTAAAAGATA52522815 TTCAGGTGGTGCAGC
TAATGTAAGTGCCTGTGTTTTCTAATGGTC64669988 TT-AGGTGGTGCCGG
CTGCCATCCAGACTAATGTAGGAGCCACTC72736177 TTCAGGTGGTGA AGG
TTCAGGTGTGTCTGTGTGCACATGTGTGTA73350883 TTCAGGT-GTGCAGG
CTAGGAAAGGTAGGACTCACATTCTCTGGT93673274 TTCAGG-GGTGCCGG
CTGGAGGATCTAAATGCTATTCACAACTGC94425893 TTG AGGTGGTGCTGG
GGAAGTAGCCCAATACCTCAGCTCTTTATT95546525 TTCAGGTGGTGCTGA
TATGATTCAGCCAGCAGGTGAAGAGGGCCT101197192 TTCAGGTGGTGCAGT
CAGGCAGCACGCAGGATCTGTAATCCTTCC102412922 TTCAGG-GGTGCTGG
TATTTGTTTCTAACCTTTAAAAATACAATA106724660 TTCAGG-GGTGCAGG
CAGTTGACATGCAAGTGGCGAGAGATCATG115828329 TTCAGGTGGT TGCAGG
TTGTTTGTATCTTCAGTTCTTCCTTCTGCT120545041 TTCAGGTGGA GCTGG
ACCGGGAAGCAGGGATCAAGGACTGTGTTC121193974 TTCAGGTGGA GCTGG
AAATCCTTTACAAATATACTGGTAGTCTAG122299362 TTCA-GTGGTGCTGG
TCTCCCACTGAGACCAGATAAAGTTGACAG124530098 TTCAGG-GGTGCAGG
GCTGTTAAAGTCCAGTGATCTAACAGACTC126793124 TTCAGC TGGTGCTGG
TACAGTGTCCTTCTCAGACTCAGAGTTGGG127377267 TTCAGGTGGTGT AGG
GTGGCTGGACTTGGTAATGTGTAAGGGTCA128615438 TTCAGGTGGTA CTGG
TCAATTGCCTGAGTAAAGCAAAGGTTTTAT130059336 TTCA-GTGGTGCTGG
GGCGAGCAATGCCAGCACTGCGGGGGCCGC130748883 TTCAGGTGA GTGCGGG
ATCTAAAATAAATATCTTTAAAAGTCTAAA131974172 TTCAGGTGGTA GCTGG
AGGTAACCAGTGTTGCATATGTTCCCTGAC133188920 TTCAGGTGGT-CTGG
CTTCACCCTCATGAGGCCAAAAGCAGCGAC137861136 TTCAGGTGGT-CCGG
TAAGCTTCTGTTTATTTGTATGTTTATTTA143450433 TTCA-GTGGTGCTGG
AGGGCTGCAGGGGAGCCAAGCCCCTCAGCC144162148 TTCAGGG GGTGCTGG
GGTGTTTTTCTTGACTTTAATTTATTTATT144244299 TTC-GGTGGTGCTGG
GAGCAAGCCTGTTCCCTCATCTGACAGAAG151756158 G TCAGGTGGTGCTGG
CGGGATAAAGGTGTGCAGCACTATGTACAG155500488 TTCAC GTGGTGCAGG
GGGAAGCGGGCTGGAACGTGACAAATGCCA158453547 TTCAGGTGA GTGCGGG
AGCTTCAGGAAGCACCCGGAGGGACCTCCT158748880 TTCAGGTGGC TGCTGG
AGAACAAAATGGGACCCCAAGCTAATGACT159438397 TTCAGGT-GTGCTGG
CCATTTCCTTCGTCTCCAGAATCTGAGAAC159726234 TTCAGGTGA TGCTGG
AGTGAAACAGGTGTGATGAGCTGAGTCTGG160733027 TTCAGGTGGA GCAGG
TCCATGTTAACTATATACATTCTTTCATGT164309746 TTCAGGTGGTGCAGT
CCACGGAGTTTTTCCTGTGGTAAAGCCTCC166200190 TTCAGGA GGTGCGGG
TATATACAGCTATACAGATGGTTGTGAGCC166750967 TTCAGGTGGT TGCCGG
TCTGAGAAAGCACTTCCCAGAAGATTTCAC167509910 TTCA-GTGGTGCCGG
GCCCTGCTCTGACCTCCATAGGCTTCTGTA169931981 TTCAGGTGGTG-TGG
CTCCTGCTCGCTCTTCTCCTGGGGCTGAGC172866362 TTCAGGC TGGTGCTGG
AAAAGGCTTTGGGGTGCTGCCAGTTCAGAC179189727 TTCAG GGTGGTGCTGG
GAACCCCACCGGACCAGTGCCTCTGGTTCC17043716 TTCAGGTC GGTGCTGG
AGAAGTAAATGAATGGCTAGACATGTAAAA21749620 TTCAGGTGGG GCTGG
GCACGGCAGCTCAGTCCTGTAATTTCCAAA22140314 TTCAGGA GGTGCAGG
GCAACAAAGTGGAAGTCTGGTTCAGAGAGC24205551 TTCAGGTT GTGCAGG
CCTCTGGAACTGGAGTAACATTTGTTAGCT28442928 G TCAGGTGGTGCTGG
TCAACATACAGGAGAATCAGGGTCCCAGTA31496165 TTCAGGTGG-GCAGG
CTTGCTCAGAGATAAACTCCCTGTTATAGC31988647 TTCAGGTGC TGCGGG
TGTAAGTGGTGGGGCCTGGAGAGCGCATGC32893816 TTCAGGT-GTGCTGG
AGTCCAGGGGCAACACACATAGGGACTTTC34663050 TTCAGGA GGTGCTGG
AGGGGAGGTTGTATACTAAGAGCAGGCCTT35275077 TTCAGGTGGTC CAGG
GTTTGCCAGCCGTTGATATCAAGAGGCATG45333199 TTCA-GTGGTGCCGG
GTGGCTGGACTTGGTAATGTGTAAGGGTCA45816758 TTCAGGTGGTA CTGG
TGGTGATATTTTAAGTGTGATCCTTTGACT49895729 C TCAGGTGGTGCAGG
TCTGTTCACTATAAGGGAACTGGGGTCAAA52226473 TTCAGGTGGT-CAGG
ACTCAGTATGTGGTCAGATTTGGAGAAAGT65165180 TTCAT GTGGTGCTGG
CCGCTTGGTCCAGTTTGTAAAAGACAGAAT67010267 TTC-GGTGGTGCAGG
TGCCAATGTGAGACAGGAGTGTGGAGTTGG67569908 TTCAGGTGA TGCAGG
GCTTGGGACGCCTCATTTGCAGGAGGGAAT80237772 TTCAGGTGC TGCTGG
TTCTGTCTCCATCTTCTAAGTTACACCTGG83965868 TTCAT GTGGTGCTGG
CTCTTCTTCCCATCTACCACCATCCCTGAC88356492 TT-AGGTGGTGCTGG
AGATGCTCCCTCTGAGAGTCTCATGTGTGT89797203 TTCAGG-GGTGCTGG
TGGCTCCCCCAGATGCTGTGGCAAAGCCCT90892532 TTCAGGTGG-GCTGG
CCTGGGTTCTATCCCCAGCACTTTATACAC96879101 TTG AGGTGGTGCAGG
GACGTCCCTTCCAAAGCCCAGAGGAATCCT97217562 TTCAGGTGGTGCAGC
TGCAACATGAATGATGTGAAAGTTAATGAT98295260 TTCAGGTGGTGT GGG
TGTGTCCTTTCTATCTGTGAATTCAAAGGT99532718 TTCAGGTGGG GCTGG
TAATTTGGTGTGCTTTCGGGAGTCAGTTCT100445431 TTCAGGG GGTGCTGG
GGGTCCAGTGAGAGTGGGTGTTGGTAGTAA102010567 TTCAGGTGC TGCAGG
GCACTGTTGACTCTTGCAGGGCCACTTGGC103507661 TG CAGGTGGTGCAGG
TGGCAGATTAATGTTCTTTACCTGGTCAGA104789155 A TCAGGTGGTGCTGG
TCCTTCTTTCTTGTTTTGGTGCCAGGGTAC113932575 TTCAGGTGGTGA TGG
AGAGACAATCAACTTAAAAAGAAAAAGGAT121446757 TTCAGGTGGTGG TGG
ATGGAATGAAGAAAAAGACGCAGCAGATGG121933300 TTCAGGTGT GTGCAGG
CTTGATGTAGGTAACGCAGGTGGTGAAGCG129044755 TG CAGGTGGTGCAGG
TTCCCACCCCGCTGAGTCCCAGGGATCAAA131080126 TTCAGGTGGT-CAGG
CAAGGCAATGATTTGGAGTCTCGGAATGTG142370679 TG CAGGTGGTGCTGG
CTAACATAAGAACTTAGTTTGGAAGAGTCA143145893 C TCAGGTGGTGCTGG
TTACTGAGAAATTCAATTGGACACGTTGGT144102644 TTCAGGT-GTGCAGG
TCTTCCACTTTATACGTCTTAGGAATCATA153584415 TTCAGGTGGT-CAGG
CAGCTGACTCCTGTGAGACACACAGGTCCT7085105 TTCAGGTGA TGCTGG
AGACAGGCAGAAGCGATGGGCAGGAAAGCC8424798 C TCAGGTGGTGCAGG
CTGCTAAAAGATATGGACTCTCTTAGGACT14095749 TTCAGGTGG-GCGGG
CACTGGAACTGCAATTAGAGGTTGTGGCTG19562167 TTCAA GTGGTGCTGG
TATTTGAACACTTCAAGGTCTGTGTTTCAT23335782 TTCAT GTGGTGCAGG
ATTCATAACTACTGCCAGCTAGTGAATGAT25229482 TTCA-GTGGTGCTGG
AAGAGACTGGAGGCCCCAGGGAGTTTATAG26080381 TTCAGGTGG-GCTGG
ATATTTGTATGAGCAGACCTATTAGAGCCC27911430 TTCAGGTGGTC CTGG
GGGACTGTGTATGTGCACCACCACTTCTGG34815621 TTCAT GTGGTGCTGG
TGTGCCTGGAGTTGCAAATGGTTGTGAGCA39528511 TTCAGGTGGA TGCTGG
CATTTGGAAGGTTGAGAGCCTACTATCATA40342021 TTCAGGTGGTGCTGT
TTTTTCCAATTTAAAAAAAAAAAAAAAGAT43517569 G TCAGGTGGTGCTGG
CTTCTGTTCTTTGGTCCTCTCAGTAACTCA45478562 TTCAGGTGG-GCTGG
CCTGCCACTAAACACACATCCTAACATACA47130555 TC CAGGTGGTGCTGG
GGGGTCACAGGTGTGAGCCATTACATCCAG47500169 TTCAT GTGGTGCTGG
GTCTGCCTCTGTCCCTTCTTCTGTAGCATT54048639 TG CAGGTGGTGCTGG
GGGGATCTGACACTTATTTTGATGTCTGCA56136674 TTCAGGT-GTGCTGG
GAGTGAATATGGTGACACACAACAACAATC57422872 C TCAGGTGGTGCTGG
AGCAGTTTCTCGCTGAATCAAGCTCATCGT59132399 TTCAGGTGG-GCTGG
TGTGGATGCCTCATTTGCATAAGGAATAAT66920550 TTCAGGTGC TGCTGG
GGAGCTGGTTATCCCGGGTGGGTGTAAGCC68031164 TTCAGG-GGTGCAGG
GCCTGCCAATTGTGGGTGTTGCTATCCCTG72269512 TTCAGGTGGTC CTGG
TTTATAAGTCCTCAGCAAAGGTTCTAAATT73941569 TTCAT GTGGTGCTGG
TTTTGCTCTCATGTATCTGGTTTATGGCTT80041507 TTCAGT TGGTGCTGG
GAGATATGATTTTAAATATGAATCTTGCTT80295874 TTCAGGT-GTGCTGG
TCCAGGGCTTGCTGTTGTGTGAAAACTGGG80632181 TTCAGGTGGTGCTGA
GATGGGTCTATGGAACTGATGGATAGGATA81087397 TTCAGGT-GTGCAGG
Data Export:
Maximum 100000 results can be retrieved in various formats shown below:
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CRISPRdirect |
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— Rational design of CRISPR/Cas target.