— Rational design of CRISPR/Cas target.
2025-06-22 06:22:49, GGGenome : Mouse genome, GRCm39/mm39 (Jun, 2020)
Summary:
Results:
Matches are highlighted with blue background.
Mismatches and in dels are marked in red.
GCCTGATTGGTGGTCCAGTGCTTGAGAGAT3196252 CT CT GGGGTTCAGGT
CTTTGGTCGGTGGCTTAATCTCTGGGAACT4360826 CCTA GGGGTC CAGGT
GCTACGCTGCCTCCGGAGTTCTTTCTGCTC4481991 CCACT GGGTTCAGGA
TTGTGCTTTCTGAGGAAGCTCAGCACTGAG4669060 CCTCGGGT TTCAGGA
CTAGGTGGAGTACAAACAGAAATCCTGGCT4697531 CCCT GGGC TTCAGGT
GTCTGGTTGGTGGCTCAATGTCTGGGAGCT6445243 CCCA GGGGTC CAGGT
CTTTGGTTGGTGGCTCAGACTCTGGGAGTG6943547 CCCA GGGGTTCT GGT
ATCTGACTGAATCCTAGTTGTGTCAGAACT7627168 CCTCA GA GTTCAGGT
CTTTAGTTGGTGCTTCAGACTCTGAGAGCT7631484 CCCA GGGGTC CAGGT
AGGAGAGTCAGCCTCCAGGGAGGCCTCTGA7704550 CCCCA GGA TTCAGGT
GCCTGGTTGCTGGTTCAGTGTCTGAGAGGT7976533 CT CCGGGGTC CAGGT
AATACCAGCATCACAAGAAATTATCCCATC7998248 CCACGGGA TTCAGT T
CTCTTTGGTTGGTAGTTTAGTCCCTGGGAG8075770 CCCT GA GGTTCAGGT
GGCAGAAGAGAAGTAGGTGGGGCTTGAAAA9385146 CCTCA -GGTTCAGGT
GTGGGTCCCTCAACCCTCAGGGAACCAGGA9594532 CT TCGGT GTTCAGGT
GGGCTGTGGGGGCGGTAACTTCGACAGGAG9680971 CCA-GGGGTTCAGGA
CTTCTTCTTCTGTCCAGGAAGACTTCTTCA9757889 CT TCA GGGTTCAGGT
TTTTCTGGTATAATTGCTAAGCAATTAAAG9873451 CCAC-GGGTTC-GGT
CAGATCTCCAGCATCTGTGTAAAAGCCAAT10790861 CCTCA GGGTG CAGGT
TCTGAGTCCCTTTACATGGAAGGCACTGGT10841476 CCT--GGGTTCAGGT
AGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTA10905757 CCCCGGA GTTCAT GT
CGACCACCACCTTCATCTCCTTTTTGTTTT11089950 CCT-GGGGTTCAGC T
TTGGAAACTGTTGATGACCTATTGTTCTTA11165852 CCTC-GGG-TCAGGT
TGTGGCCTCTGCTGACTTCTAAGTGTGTGG11221771 CCTCT GGGTTCAT GGT
GACTCCTAAATTCTCTGGGGCCTCCATTCT11805152 CCTG GGGGTT-AGGT
TGCCTGGTTGGTGGCTCCGTGTCTGAGAGA13756165 T CTCGGGA GTTCAGGT
GTGAGCAATAAGTTTTCATTCCCCAACTGG14645482 CCT-GGGC TTCAGGT
CAGGCTGCAAAGTCCTCTGAACACTCAACT15274908 CCA-GGGGTTCAGGA
CACCCCTGTGGGCCGCTTCTTCATGGAGTA15359226 CCTCT GGGTTCAGGG
ATGTTGTCTCCTCCCAGCTGCATTTCCACG15730279 CCCCGGGG--CAGGT
TGGAGAGTACTCTGGGGTCCTTGGTGGCCT16935976 CT GCT GGGTTCAGGT
TTTGGACTATAGTTCTCTCTGTGCCTATAT17118511 CCACT GT GTTCAGGT
CCTGGTTGATTGCTCAGTTTGTCTGAGAGA17388599 CCTCA GGGGTTCAGGT
AGCACCCTGAAAATGCAATTCCTGCACTAT17563200 CCTCGGT GTTCA-GT
TCTGCTACATATGCAGCTAGAGATATGAGC17616419 T CTG GGGGTTCAGGT
GCCTGGTTGGTGTCTCAGTGTCTAAGAGAT17657277 CCTG GGGGTC CAGGT
TCATTTCACCTTGTCCTGGGGACGCCCTCC17798164 CCGCA GGGTTCAA GT
TGGAGAGTTCTCTGGGGACCTTGGTGCCCT18144080 CG TCT GGGTTCAGGT
CTATCTGACCTCTGATATAAGATCATGGGA18212712 CCACT GGT TTCAGGT
TGGAGAGTACTCTGGAGCCCTTAGTGGCCT18990506 CCACT GGGTTCAGGT
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAATG19146962 CCAT GGT GTTCAGGT
AAGTCTGGAGCTCAGATCCACCTCCTGAGT19386358 CCCCGGGG-TCA-GT
AATCCAGAAGCTGACTATTGGACTACATAT19532816 CCCCA GT GTTCAGGT
TGGGTGTCGGGCGACTACGCTCGCAAGGTA20115176 CCCCGGGGTTCAA GT
GGGGCCAAGCCAGTTCTCTTGCTCTCATGA20985105 CCCCA GGG-TCAGGT
CAGCATTGGTTTTTAAATGTTTAGCAGGCA21384221 CT TCC GGGTTCAGGT
TTTAATAGGGTCCTCAGAGTGAGGGGACCA22461414 CCAA GGGG-TCAGGT
GCCTGGTTGGTGGCTCAGTGTCTGAGAGAT22873093 CCTG GGGGTC CAGGT
GGGCTGTGGGGGAGGTAACTTTGACAGGAG22999222 CCA-GGGGTTCAGGA
AGGAGAGTCAGCCTCCAGAGAGGCCTCTGA23442152 CT CCGGGA TTCAGGT
AGAAGCCACTCAGTATCTGTCCTCCCAGGA23667154 CCCC-GGGTTA AGGT
TTCCGTCCTCCCGGCTTCACTTTTGAGTGG23695641 CCTC-GGGTTCA-GT
TTTTCAGCCTTACCTTGGGGCCCTGGATCT24309464 CCTG GGGGTC CAGGT
GGTAAGAACACATCTAAAAACCCTGTCACA25509260 CCG-GGGGTTCAGGG
TTTTGGTTGGTGGCACAGACTCTGGTAGCT25557553 CCCA GGGGTC CAGGT
TATTTCAATTAAAAGTTTGTTTTAATTTGC25734035 CCAT GGGT TTCAGGT
TTGCACTAGGATTCTCTGAGGTCCTTTCTA26676368 CCCCA GGGTA CAGGT
ACAGTGAAACTAATTAGGCATTATCCCGTC27112482 CCACGGGA TTCAGT T
AGGAAAGTTGGCCTCCAGAGAGGGCTCTGA27300590 CCCCGGGT C TCAGGT
CTGCTAGAATGTCTTGAAAGAAGGACACAC27305245 CCTCA GGT TTCAGGT
CTTTAGTTGTTGGCTCAGTCTTAGGGAGCT27833979 CCCA GGGGTC CAGGT
GGGCTGTGGGAACAGTAACTTTGACAGAAG29715353 CCA-GGGGTTCAGGA
TGCCTGGTTGGTGGTCTAGTGTTTGAGAGA29826370 T CACGGGGTTCAGGT
CTTTGGGTGGTGAGTTAGTGTTTGGGAGCT29862500 CCCA GGGGTC CAGGT
TTTTCATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAG30741557 CT CCGGGGTA CAGGT
CTCAATGAGACTTTTGTACCAAATGCCTCC31397928 CCTCA GGGTTCAGGA
CGATGCCAAATAAAGGGAAAGGTATATGTG32870247 CCAT GGGGTTC-GGT
GTCCAACCTCTGGCTCAGTCTCTTAGAGCT33418146 CCCCT GGGTC CAGGT
GCTGGCCAGCAAGGCTAGCCATGTAGGTGA33652049 A CACT GGGTTCAGGT
GACCCTAACCCCAGTCCTCTTGCTTGTCCT33763320 CCCCGGGC TTCAGC T
TATTATATAGCACAAATTCAGGCTCTCCTG33763417 CCTCGGGGTC CAGGG
CTTAGTAGTCTCTCAAATACCCTTGCCAAA33799446 CCACGGT GTTCAGC T
GACAGAGAGTGGTGTGAATTGGAGTCCTAG34042249 CCCCGGGG-TCAGGA
ACTTTTAGAAAGAGTGCAAGTTGACAGGAA34262076 CCT-GA GGTTCAGGT
CATGGCCAAAGGCTCTAAACTTACTCTTAC34281071 T CTCGGGG-TCAGGT
AATTATAACCGGATGAGGTGAGGTCAGGAG34834525 CCCCGGGGTTG CAC GT
CTAGGGGAGGCGCTGCTCACTAGGCCAAAG34851949 CCTCA GGGTTCT GGT
TACACTGTATACACATAAACCAGATTACAG34897518 CCCCA A GGTTCAGGT
GGGTGTGCTGTAATTTGAATGTGAAATGTC35181283 CCTCGT GGGTTCAT GT
CTTTGGTTGGTGGCTCAGTCTCTGGGAGTT35510140 CCCA GA GGTTCAGGT
TCCTGGCTGGTGGCTCAGTGTCTGAGTGAT35583485 CT CA GGGGTTCAGGT
CTGTGGTTGGTGACTTAGTCTCTGGAAGCT35656350 CCCG GGGGTC CAGGT
GAAGGAAGGCACCCCAACAGCGGCACTCCT35960799 CCAT GGGA GTTCAGGT
GTCTTGTTGTCAGCTGTTCACCTGGCTGAG35996871 CCCT GGGGTTCAGC T
TTTCTGTTCTCATGAGAGTTTATGATTCCT36292263 CCA-GGT GTTCAGGT
CCATTCCTCCCCTCTCCATCTTCCTGGCAG36295150 CCGCGGGGTG CAGGA
CAGCTCCTGAGCGTGGAGCTCCAGCTCAGC36458897 CCCCGGGGTG CAGGG
AGACTGGAGATAGGGTTAGGTTTACACTTG36594613 CCCT GGGGTTCAGGT
GTCTGATTCTCCGCTATCAGACCGTCACCT36798172 CCGCGGGGA A CAGGT
TTTTGCTGTTTATAGATTTAGCCCCAGTTG36824218 CCCCGGGGG -CAGGT
GCCTTCATACTGCTTTGTGAAGTTAGAGAA36837000 CCTCT GGC TTCAGGT
CTAGTGAGCTCCAAGGGTTTGTTTCCCCTA36924239 CCCCA GGGC TCAGGT
CAATGACCTGGCACTCAAGTGTCATCTGTC37029456 CCTCA GGGGTTCAT GT
CCTAAATGGATGTCTTCACCAAACCTCTCC37046591 CCTCGGGG-TCAGGG
GTCGTGTCCAGTCACAGGTATGGCCTATGC37223098 CCACGGGG-TCAGGG
AGCAGTTTTTAAATAAAATGAAGGATTTCT37264222 CCA-GGGC TTCAGGT
TCAAGCTTGGCATGTGGCCCAGCAGTGAGA37667847 CA TCA GGGTTCAGGT
CTCAGAGGCAGAACATCTGAGGTTGAATGG37727404 CCCCT GGGTTCA-GT
CTGATACATATGCAGCTAGAGACACGAGCT37803729 CCGG GGGGTTCT GGT
AAGTCAAAAGACACCATTAAAGATTCACCC38470060 CCAT GGGG-TCAGGT
TGATCCAAGCGCTGTTCTAACTGACCATGG39135613 CCACA GT GTTCAGGT
ACGCCACAGTCTGCTAAGGTCTGCCTTGTG39193904 CCCCA GGGTTCAT GT
TGACATACAGTGGTCCCTTGTGCCCTTGGG39241876 A CTCGGGGTT-AGGT
CTCATTAGGATGTCTTCATCGAACCTCTCC39535298 CCGCGGGGC TCAGGG
TGTGGTGTGTATGTGACTTGGCAAAGGCCT39806691 CCACT GGGTTCAGGA
TGCTGGAAAGTTAGCACGGGGTCAGGAAGT39898520 CCT-GGA GTTCAGGT
GTAATTTGGGGACCTAGAAAAAAGTGTCTT40008106 CCT-GGGGTTCAGGA
AAGAGATGGCACTGTGGAAGTCAGATCCCT40561572 CCCCGGGGT TTCAGA GT
CATGGTATGGGGGTTTCAGTAGATTTGGGG40651639 CCT-GGGG-TCAGGT
TCACAGTTACCTGTAGGATTCAGCGCAGTG40980262 CCACGT GGTTCAGT T
CCACAGGTCCTGCTCCGGGACCCAGGGAAT41305973 CCTCGGGGTC CAGC T
GGAAGAAAGAGGAGCTGGTATCAGTCAGTA41909593 CCA-GGGGTTA AGGT
CAGAATTCCTTTAAGTTCCTACTGATAGTT43586743 CCCCGGGGC -CAGGT
AGTCACCAAAGCCAATCTGTGTAATGCCTC43646672 CCACGGGG-TCAGA T
AGGTTGCCTATTTCCATTCTTTCTGCTGAC43685069 CCTCGGGGC TTCA-GT
TGTGTGCTATGTTCCTGGCATGTTAGAGCT43929299 CCTG GGGGTC CAGGT
GTTGAGAGCACTGACTTCTCTTCCAGGGGT45770148 CCT--GGGTTCAGGT
GCCCACAAATGCCAGAAGAAGGCATTAGAA46109065 CCCCGGGGTTCAA A T
AAGCTGCTATGAACATAGTGGAGCACATGT46140933 CCTT GGGGTTCA-GT
TATTTACCAAGCCTTCCCACCCCAAGCTGG46465126 CCT-GGGGTTCA-GT
GCCTGTATGGTGGTTCAGTCTCTATGAACA47023265 CCCCT GGGTC CAGGT
GCCATCTTTTGATACATATGCAGTCAAGAG48066789 CT CCGGGGTA CAGGT
TCTCTGGTTGGTGGTTCAGTCTCTGAGAGT48886185 CCCA GGGGTC CAGGT
GCATGTTGGTGGCTTAGTCTATGGGAGCTT49850007 CCA-GGGGTC CAGGT
AGGTTGCCTGTTTACATTCTTTCTGCTGGT50228995 CCTCGGGGC TTCA-GT
TTGTGGCTTGAGTGCATAAAAACTCTTGAA50851607 CCCCGGGGC TCAGGG
GCTCTTTGGTTGGCTTAGTCTCTCAGAGCT51044441 CCCA GGGGTC CAGGT
AGGTATATTCTGATAGACAGACCCTGTACA51214437 CCT-GGA GTTCAGGT
TTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAG51470867 CT CCGGGGTTCT GGT
CAATAAAGCCCATCGCAAGGGTTTATGTGG51915302 CCCCGGT GGTT-AGGT
TGGTAGTTGCAGTCACAGCAGGCTCTGTGT52560494 CCTCT GGGTC TCAGGT
CTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCAGGGAGTT52805720 CCG-GGGGTTCT GGT
TGCCTGGTTGGGGTTCCAGTATCTGAAAGA53165763 CCTT GA GGGTTCAGGT
GCCTCAGTGACACCTGGAGAGTGTCTGGTT53229829 CCTCGGGG-TCT GGT
CAACCTGACAACCTAACAAAACTTTTCAAA53251053 CCA-GGGGC TCAGGT
ATTTATTTCCTGCTATATTTGAAAGGAGAA54408342 CCACA T GGTTCAGGT
CTTTAGTACAGGCTCTGGTGGCGGGCCACA54702912 CCTCGGGGTTCT AGGC
CAGACTTTGTGCTGTGTCAGCTTCATGAGT55207214 CCT-GGGGTTG CAGGT
AGGTGGAGGTCAAAGTGTAGGTAGCAGAGA56000916 CCCCT -GGTTCAGGT
TTAACATTGTCTTTGGATCACTTTGTTTCC56166733 CCACA GGA GTTCAGGT
TCATTTGTAAGCAAGCTAGAATCCATAGAA56622237 CCACA GGGTTT AGGT
TCGGGTATCACTTTGACCCTCCTCCTGTCT57022115 CCTCGGGGTG -AGGT
CTTCCTTTTGGACAGGAGAGAGCATGGAGT57081503 CCCCGGGG-T-AGGT
TGTCCCAGTCCTATGTATGATGCTAAAGGG57160681 CCT-GGGG-TCAGGT
TGTTCTGTGGTGCTCAACACATGGCTTCTT57196116 CCTCGT GGTTCAT GGT
TACCAAGTGATCGTGGACTCCACGTGCTTG57650093 CCA-GGGGTTC-GGT
ACATTCCTTCTGGTCATCCTTGCCCAAGAA57675798 CCA-GGGGTTG AGGT
GTACACTGCACTAATGACCTGAAATATTCG57715633 T CTCGGGGTTC-GGT
CAGAGTATATGTAATGAACAGGTGAGAGGT57923722 CCT--GGGTTCAGGT
GTCCCATGTAGGTGAATTATCACCACCGGG58270054 CCCCGGGGTTCAGA C
ACTGGGCAGCCACACTAGCCAACTGGTAAA58278040 CCCC-GGGTTCA-GT
CCTTCCTGTGATCCTGGTTGTGTCAGAATT58425911 CCTCGGA GTTCAGC T
TGGAAGTAAATTCAAGGAGTCTAATTAAAT58751408 CCTCC GGGTTCAGGT
TTGGGAGAGGGCTATCCTAGCAAGCACAAA58762531 CCCC-GGGTTCA-GT
ACAGAGTCTTCGCCCCTCTTTCTCCTGCTG59330247 CCT-GGGC TTCAGGT
GGCTCCGAAAAGATGTGAAAAATCAAGAGC59724525 CCGCT -GGTTCAGGT
TAGACACACGACCTTAAGCAGTAGAATGTC60639993 CCTG GGGGTTCAT GT
TCATCAGTACTGGCATTGCAAGTGTGTGCA60658205 CCACT GT GTTCAGGT
GCCTGGTTGGTGGCTCAGGTTCTGGGAGCT60724454 CCCA GGGT TTCAGGT
TACATTACATTCCAGCCATTTTTTGCAGCT60991278 CCACGGGC C TCAGGT
AGTCTATGAACAGTCTTATTTGAAGGGAAA61703933 CCTT GGGGC TTCAGGT
GAGGACTTAAAAGGAGGGTATGGGATTTTA61742645 CCCCT GGG-TCAGGT
TTTGAATCAGCTTTGATAGGTTGTGGGATT62018388 CCA-GGGGTTCAT GT
CCAGCATTGAGGAGGCAGAGGCAGGTAGAT62940433 CCCCA GGGTTCAT GT
AACAGGTACAAAAAAAACTAGCACATGATA63246296 CCAA GGGC TTCAGGT
GTGGAAGACTTGCCTGGCATGTGCAGAAGA63296589 CCCC-GGGTTCAGT T
AAGACTGGGCAACTTTGGGGAGTCCTAACT63541332 CCCT GGGGTC CAGGT
CATGTGATATTGAAAATGAGAATGCTCAGG63612754 CCCCGA GG-TCAGGT
TGCCATGGTTACCGCAGGACTCGAATCAGA63868753 CCACA GGGTTCT GGT
AGTTAATCCCTAAGCGTCCCTTAACCCGGT64028051 G CTC-GGGTTCAGGT
GAGTCAGCTCAGGAAATTCCTGTCTCCGGC64907147 CT GCGGGT TTCAGGT
TCTGCTGTTAGTTCTAGTTGGAGTCCTCCC65081635 CCTCGGGG-TC-GGT
TCTTTGGTTGGTGGTTCAGACTCTGAGAGC65329140 CCCA A GGGTTCAGGT
CACTATTTTCTGGCTCTTACTGTGTTCCTT65423308 CCTA GGGG-TCAGGT
GTCTGGTTGGTGGTTCAGTGTCTGAGAGAT66602158 CT TG GGGGTTCAGGT
AATGGGAGAAACTGTTGCACTTGGGGAAGT67647935 A CT-GGGGTTCAGGT
CGGGTGTTGGGCAACTCCGCTGGCAAGGTA67664986 CCTCGGGGC TCAA GT
CTGATACATATGCAGCTAGAGACATAAGCT68563402 CCACGGGGTA CT GGT
TGTCTGGTTTCAAAACTCCTTCCTTATGAT68718107 CCTCGGT GTC TCAGGT
GTTGTTATAAACTAACTGGCACTGGGTTAA68974129 CCCCA GGG-TCAGGT
TGCCCTGGCTTATCTTTTTCAAGCTCATCC69585623 CCACT GGGTTCT AGGT
CTTTGGTTGGTGAATTAGTCTCTAGGAACT69842599 CCTA GGGGTC CAGGT
CTTTGGTTGGTGGCTTAGTCTCTGGAAACT69947704 CCCA GGGGTC CAGGT
AGTAAATCAAGTCCCAAGAGAGCTGTTAAG70982046 CCACGT GT TTCAGGT
TATTTGCCCATGTCTCGTGGTCTTTGGGGT71152799 CCACA GGGGTT-AGGT
AGGCTGCAGCTCACTGGAGGAGGGGCGGGA71596299 CCTCGGGG-TCAC GT
TCATGAAGAGGCTGGCTAAGCCAACAAAAC72011012 CCACGGGGTA CAGA GT
ATCAAAGAGAAATACATGTAACATTTAGAA72091604 CCTCT GGT TTCAGGT
GGCGTCTCTAGATTCATCCAGGAGTCCCCA72431286 CCAC--GGTTCAGGT
TGTCCAGCTCCAAGCTAATAGACTTCAGGT72720400 CCTA GGGGTTCA-GT
TCCATCTTATTCTGAATAAGAGATCTGTGG72845000 CCA-GGGGTTCAGC T
TCCTCGCAGGCTTTACAGTTCATTTTTGTT72874526 CCCCT GGGTTCA-GT
CAGGCCATCCATCTACACTGTTTGCAGTGG73346631 CCCCGGGC TA CAGGT
GGGCTGTGGGGGTGGTAACTTGGACAGCAG73369411 CCA-GGGGTTCAGGA
TACGCTTCTGTTTAAGAGATGGAGATTAAG73383640 CCT-GGGT TTCAGGT
AGGAGGCAGCCACGCCACACAATAAGTTCA73551266 CCACGGGGG -CAGGT
TAAAAAACACCAGGCAGGACTTCTGGCCAT73705830 CCTT -GGGTTCAGGT
GGGTCCTGCGGGAGGGGCATGCATGAGTGG73947421 CCTCGGGGTT-AGGG
GCCCAGCTCTGTTAAATGTGGCAGGCAACA74033574 CCCA GGGGTTCAGGG
TGTCTGGCCTGGAGTCCAGGCTTTCCTCAG74116424 CCTCGA GGTTCAGGG
Data Export:
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[Full Text]
— Rational design of CRISPR/Cas target.